Située au sud de Chablis, dans la ville haute.

Sa construction daterait de la fin du XII^e siècle. (Époque charnière roman-gothique).

Son histoire débute par une hypothèse.

Une première église appelée Sainte-Marie aurait été construite sous Charles-le-Chauve, au IXe siècle, puis appelée église Notre-Dame du Rosaire, tout près de l’église actuelle.

Le plan initial montre une nef à trois vaisseaux, qui subsistent à ce jour.

Au XVIe siècle, le chœur et le sanctuaire ont été reconstruits.

Cette nouvelle construction était désaxée par rapport à la nef.

Au XVe siècle, un passage est percé sur le mur sud, dans la première travée, donnant accès à l’église Notre-Dame-du-Rosaire.

En 1726, la flèche de la croisée du transept s’effondre sur le chœur.

L’église Saint-Pierre résista à l’invasion des Huguenots en 1568, malgré la destruction totale du faubourg c. a. d. de la ville haute.

Entre 1732 et 1748, reconstruction du clocher actuel.